文化融合中，俨然已成为正统文化的象征。是清朝历任皇帝都极力推崇孔子，最终把祭孔仪制提升到大祀，将孔子的地位推向历史的最高峰。定都北京后，以京师国子监为太学，立文庙，称孔子 “大成至圣文宣先师”。祀礼规格又升为上祀，奠帛、读祝文、三献奠爵，行三跪九拜之礼。雍正二年（1724），曲阜孔庙发生火灾，雍正帝胤禛遣官祭慰的同时，敕谕重建，八年庙成，以“黄瓦画栋”，享受帝王庙宇规格。乾隆二年（1737），高宗特命北京孔庙的大成门、大成殿、也都着用黄瓦。乾隆三年，北京孔庙着用黄瓦工程竣工，乾隆帝亲诣孔庙行礼祭先师孔子。《清史稿》记载：“（雍正）四年（1726年）八月仲丁，世宗（即俗称的雍正皇帝）亲诣释奠。初，春秋二祀无亲祭制，至是始定。十一年，定亲祭仪，香案前三上香。”还规定八月二十七日为孔子诞辰，全体官民军士斋戒一日。《清史稿·》里还记载“丁祭不得陪祀者，当於前一日瞻拜。”说明了祭孔在清朝的重要程度。
  辛亥革命胜利后，出任南京临时政府教育总长的蔡元培先生，停止孔子“丁祭”，后来北京大学有人做诗，说到蔡元培的一句就是“毁孔子庙罢其祀”。汪大燮担任教育总长后，策划组织了“给孔子过生日”的活动，1912年9月24日，教育部令10月17日为孔子诞日，全国各校应开会纪念。1913年9月17日，北京教育部通令“旧历八月廿七日为孔子生日，应定是日为圣节，令各学校放假一日，并在该校行礼。”
  康有为等人组织了“孔教会”，试图恢复传统的祭孔活动，与妄图恢复帝制的袁世凯不谋而合，1913年９月７日（仲秋上丁日）孔教会在曲阜孔庙举行祭孔大典。袁世凯特派代教育总长范源濂致祭，授衍圣公孔令贻一等大绶宝光嘉禾章。袁世凯先后颁发了“尊崇孔圣文”和“祭孔令”，规定每年仲秋上丁中央和地方一律举行“祀孔典礼”。1914年9月28日，袁世凱在一大群全副武裝的侍从护卫下于早晨6点半抵达孔庙，换上了绣有四团花的十二章大礼服，下围有褶紫缎裙头戴平天冠，俎豆馨香，三跪九叩。进行了中华民国首次“官祭孔子”活动。
  蒋介石信奉儒家思想，一九二八年六月，蒋介石来曲阜祭孔，加封孔德成为“特任奉祀官”，并发布尊孔布告，封孔子为“千秋仁义之师，万世人伦之表”。1934年,国民党将每年的8月27日定为先师孔子诞辰纪念日,并列为国家纪念日,规定休假一天。儒家的经典如大学、中庸、论语、孟子等被列为各级学校的必修课程。从那时起，祭孔时间就由过去的春秋丁祭改为孔子诞辰日祭祀，直到今天，台湾还是沿用诞辰日祭祀的惯例。1948年是曲阜等各地孔庙最后一次祭孔，1949年全国各地解放，中国大陆的祭孔活动暂告结束。
  在中国2500多年的祭孔史上，不仅祭祀孔子，还有一大批配享的圣哲先贤。
  孔子四位最杰出的孔门弟子颜渊、曾参、子思、孟轲是第一批配享的圣哲，称为"四配"。最早得到配享殊荣的是颜回。颜回，字子渊，习称颜渊，与其父颜路都是孔子的学生。颜渊是孔子最得意的弟子。颜回"一箪食、一瓢饮，在陋巷，人不堪其忧，回也不改其乐"，一心向学；又有"闻一知十"（《论语-公冶长》）的能力。孔子以德行、言语、文学三个科目评价学生，德行以颜回为首。有一次鲁哀公问孔子，弟子中谁最好学？孔子说"有颜回者好学"，又说，颜回死了以后，"未闻好学者也"（《论语-雍也》）。颜回终身不仕，一直追随孔子，亲如父子，"颜回之于孔子也，犹曾参之事父也"（《吕氏春秋-劝学》）。所以，后人把他看作是孔子最亲近的弟子。三国魏正始二年（公元241年）春二月，齐王使太常以太牢祭孔子于辟雍，以颜渊配。这是以颜渊配享孔子之始。
  第二位进入配享行列的是曾参。曾参，字舆，也是孔子最优秀的学生，与父亲曾点也都先后师从过孔子。曾子是著名的孝子，主张对父母"生，事之以礼；死，葬之以礼、祭之以礼"（《孟子-滕文公上》），唐人皮日休说"曾参之孝感天地，动鬼神，自汉至隋不过乎"（《宗圣志》卷七）。曾子又是一位刚毅超群的人，"辱若可避，避之而已。及其不可避，君子视死如归！"（《春秋繁露-竹林》）"可以讬六尺之孤，可以寄百里之命，临大节而不可夺也。"（《孔子-泰伯》）等名言都出自曾子之口。所著《大学》为《四书》之一，被誉为"儒学纲领"、"入德之门"。唐睿宗太极元年（公元712年），释奠以曾参配，是为曾参列入配享之始。
  第三位是孟子。孟子受业于子思子的门人，是继孔子之后，儒学史上最重要的代表人物，被后人尊为仅次于"至圣"孔子的"亚圣"。孟子将孔子的德治思想发展为"仁政"学说，在政治思想史上具有重要意义。孟子还提出了"君轻民贵"、"性善论"等颇具影响的观点，他的心性学说，开启了宋明理学的先河。所著《孟子》七篇，在宋代列入《十三经》和《四书》，影响至巨。宋神宗元丰七年（公元1084年），孟子开始进入配享行列。
  最后一位是子思，即孔子的孙子孔伋。子思幼年丧父，故一直与孔子一起生活。成年后曾为鲁穆公师，在学术上很有建树，后人曾将他的二十三篇汇编为《子思子》一书，可惜除《中庸》一篇因被收入《礼记》而得以流传至今外，其余均亡佚于隋唐之际。《中庸》在中国哲学史上居有重要位置，韩愈认为其重要性与《易经》、《孟子》等同。程颢、程颐视之为"孔门传授心法"之作。朱熹将其列入《四书》，从此成为士子必读的经典之一。宋度宗咸淳三年（公元1267年），子思开始进入配享行列。
  南宋咸淳三年（1267年）春正月戊申，度宗到太学谒孔子，行舍菜礼，以颜渊、曾参、子思、孟轲配享。顾炎武非常称赞理宗将颜、曾、思、孟配享孔子，他在《日知录》说：“自此之后，国无异论，俗无异习，历元至明，先王之统亡，而先王之道存，理宗之功大矣。”
  如果说"四配"是祭孔时陪祭的第一等级，那么"十二哲"就是其第二个等级了。据《论语-先进》，孔子曾经用德行、言语、政事、文学四科评定他的学生的优长："德行，颜渊、闵子骞、冉伯牛、仲弓；言语，宰我、子贡；政事，冉有、季路；文学，子游、子夏。"
  因此，这十人被公认为孔子的好学生。开元八年（公元720年），唐玄宗诏令国学祭祀孔子时，以这十人为"十哲"配享。
  孔孟之后，儒学最杰出的功臣是朱熹。朱熹（公元1130年-1200年），字元晦，号晦庵，祖籍徽州婺源（今江西婺源），生于福建南建（今福建南平）尤溪县。朱熹是程颐三传弟子李侗的学生，于学无所不窥，经史、文学、释道，乃至自然科学，无不精研。在贯通百家的基础上发展了宋代理学，成为理学的集大成者。所撰《四书集注》，水平超绝，故被元、明、清三朝科举考试的官定文本，对中国的思想文化产生了巨大的影响。朱熹又是伟大的教育家，一生从事教学活动，并提出了一套富有特色的教育思想。鉴于朱熹对儒学的杰出贡献，康熙五十一年（1712年），增补朱熹为第十一哲。
  乾隆三年（公元1738年），清人又增补有若为第十二哲。有若的事迹，文献记载很少，后人对他了解不多。但有两件事很值得注意，一是《论语-学而》录有三段有若的言论，而且孔门中唯有有若与曾参两人称"子"；此外，孔子死时，鲁哀公诔之；有若死时，鲁悼公吊之；可见有若在孔门的声望。二是《孟子-滕文公上》记载，子夏、子张、子游等认为有若的言行、气质与孔子很相像，打算用侍奉孔子之礼事来侍奉他。孔门弟子对于有若的推许，也由此可知。因此，南宋咸淳三年，因颜回升为"四哲"，拟从孔门弟子中递升一人进入十哲，儒臣多推有若，最后祭酒上书力诋，只得递升子张入十哲。直到乾隆三年，有若终于成为第十二